O Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas, acreditado pela Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior, está estruturado em 10 semestres/300 ECTS, sendo que o último semestre consiste num estágio profissionalizante.

O Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas tem como principal objetivo formar profissionais de saúde devidamente habilitados a desempenhar, com total competência e responsabilidade, a profissão de Farmacêutico de acordo com todas as atividades descritas no estatuto que regulamenta a Ordem dos Farmacêuticos. Tais atividades incluem a Farmácia Comunitária, a Farmácia Hospitalar, a Indústria Farmacêutica, a Distribuição Grossista e as Análises Clínicas. Proporciona também várias saídas no ramo da Investigação e Desenvolvimento, em áreas tão díspares como a Genética, a Microbologia, a Química, a Tecnologia Farmacêutica, a Imunologia e a Farmacologia.  

O plano curricular está de acordo com o descrito na Diretiva Europeia Regulamentadora do Ensino Farmacêutico, condição obrigatória para a inscrição na Ordem dos Farmacêuticos e obtenção da carteira profissional de Farmacêutico.

Saídas profissionais
Os mestres em Ciências Farmacêuticas podem exercer atividade profissional, com total competência e responsabilidade, em áreas como: Farmácia Comunitária (incluindo Direção Técnica); Farmácia Hospitalar; Farmácia Clínica; Indústria Farmacêutica (nas vertentes de Investigação e Desenvolvimento, Produção, Controlo de Qualidade e Assuntos Regulamentares); Distribuição Grossista; Análises Clínicas; Investigação e Desenvolvimento, em áreas como a Genética, a Microbiologia, a Química, a Tecnologia Farmacêutica, a Imunologia e a Farmacologia.

Provas de ingresso
Regime geral: Biologia e Geologia